Rückkehr der Logik

Strother Moore von der University of Texas entwickelt seit drei Jahren Programme, die knifflige Probleme lösen. Solche Maschinen für logisches Denken sind unter anderem bei der Chipentwicklung von Nutzen. Mit der funktionellen Biologie visiert Moore nun ein frisches Anwendungsgebiet an. In diesem untersuchen Molekularbiologen und Bioinformatiker, wie Proteine bei ihrer Synthese in der Zelle und der anschliessenden Ausübung ihrer Funktion von einem Zustand in einem anderen übergehen. Diese Übergänge - oft durch chemische Veränderungen herbeigeführt und von räumlichen Strukturänderungen begleitet - sollen künftig mit Logikmaschinen berechnet werden.

Richten soll das die so genannte «Pathway Logic», ein Logiksystem, mit dem sich Abläufe in biologischen Systemen beschreiben lassen. Das Programm erhält als Regelsatz alle chemischen Umwandlungen, die bei Proteinen bekannt sind. Darauf basierend werden Prognosen erstellt, ob ein bestimmtes Protein unter gegebenen Bedingungen in einer Zelle produziert werden kann.

Mehr über "Pathway Logic" lesen Sie in Computerworld-Ausgabe 12 vom 24. März 2006.